构建合理的阵容是通关的核心要素。二周目敌方训练家等级显著提升，阵容更加多样化，单一强力精灵已无法应对所有战斗。队伍需兼顾属性平衡与专精分工，覆盖尽可能多的属性克制关系，同时明确每只精灵的战斗定位，如坦克型、输出型或辅助型。属性克制方面，建议包含火、水、草、电等基础属性，并补充龙、冰等特殊属性以应对后期高难度战斗。
阵容构建需考虑精灵的个体强度与技能组合。初始御三家（妙蛙花、喷火龙、水箭龟）因其全面性可作为基础选择，闪电鸟、急冻鸟等传说宝可梦在特攻领域表现突出。钢系如大钢蛇能提供稳固防御，暴鲤龙的水/龙属性兼具输出与抗性。技能搭配需注意互补性，例如电系精灵配备十万伏特应对飞行系，草系精灵携带睡眠粉控制战场。努力值分配应强化精灵的核心能力，速攻型优先速度与攻击，坦克型侧重HP与防御。
实战中需根据对手阵容灵活调整战术。面对四天王时，冰系天王需准备火/格斗系精灵，龙系天王需要冰系技能压制。七岛任务中的火箭队余党多使用毒/恶系，超能/地面系效果显著。重要战斗前建议存档，针对神兽捕获需准备状态异常技能与高级球。彩虹通行证获取后，七岛间的自由移动允许玩家反复练级，这是提升队伍整体实力的关键阶段。
后期阵容推荐组合包括：水箭龟（水）、喷火龙（火/飞行）、雷丘（电）、霸王花（草/毒）、急冻鸟（冰/飞行）和超梦（超能力）。该组合覆盖14种属性，弱点较少，且每只精灵都能通过技能学习器扩展打击面。二周目新增的全国图鉴精灵如巨钳螳螂（虫/钢）和班基拉斯（岩石/恶）也可作为备选，它们的高种族值能有效提升队伍上限。
定期检查精灵个体值与性格加成，通过特性石调整隐藏特性。道具配置要突出重点，例如生命宝珠强化输出，剩饭维持续航。记忆技能的老者位于水静市右上角，可删除冗余技能腾出技能栏位。二周目最终挑战前，建议将主力精灵等级提升至65级以上，并完成全部隐藏道具收集以强化装备。
二周目通关不仅是等级压制的结果，更是战术思维的体现。理解属性相克机制、掌握技能优先级、合理分配资源，这些要素共同构成胜利的基础。游戏设计者为二周目准备了更丰富的挑战内容，只有经过精心规划的阵容才能完整体验这些隐藏要素。
