舰队分配的核心在于明确功能定位与战术协同。舰队通常分为主力舰队和高速机动舰队两类，主力舰队承担正面作战任务，需配置高防御高火力的舰船如战列巡洋舰和重型巡洋舰，确保持久作战能力；高速机动舰队则侧重快速包抄和战术突袭，以护卫舰和驱逐舰为主，利用其移动速度优势实现战场控制。两类舰队的指挥值分配比例建议维持在7:3左右，既保证主力强度又保留战术灵活性。
资源采集型舰船应独立编组，与战斗舰队完全分离。工程船需优先升级仓储和采集效率技术点，中期建议逐步替换为中型工程船以提高效率。采矿平台选址需覆盖高级资源带，同时注意基地与平台的距离规划，避免工程船因巡航速度浪费过多时间。防御方面需为采集舰队配置至少2-3艘护卫舰，防止敌对势力骚扰，但不宜过度投入战斗单位影响采集效率。
舰船攻击序列和武器克制关系直接影响战斗效能。能量武器型舰船对装甲单位有显著穿透效果，而实弹武器则擅长应对轻型目标。舰队编成时需保持前排6艘以上防御型舰船形成交叉掩护，中后排配置差异化武器系统的巡洋舰实现火力覆盖。移动速度作为关键属性往往被忽视，编队时应确保同舰队舰船速度差异不超过20%，避免高速舰船被低速单位拖累战术执行。
防空特化舰队应搭载防空战机和脉冲型驱逐舰，专门应对航母编队；攻城舰队则需集中高攻城值舰船，以前哨站和采矿平台为优先目标。所有舰队配置都要考虑策略值消耗效率，避免因单次行动消耗过高导致战术僵化。联盟协同作战时，舰队配置需与盟友形成互补，而非简单堆砌同类舰船。
每艘舰船的5-7个改装位需针对性强化，前排单位优先护甲与闪避，输出单位侧重伤害与命中。技术值分配应当集中关键型号，避免平均主义导致战力稀释。载机型舰船的护航艇配置需要根据当前版本主流舰船类型调整，保持对中型舰的压制力。
保留足够资源应对新星系环境，及时调整舰船比例适应未知威胁。舰队管理界面应建立至少三套预设方案，分别应对常规作战、资源争夺和紧急防御等不同场景。最终成型的舰队体系应当兼具稳定性与应变能力，在火力、机动、防御三个维度达到动态平衡。
